Wikipedia

Helen M. Berman

ikertzailea

Helen Miriam Berman Rutgerseko Unibertsitateko Gobernadore Batzordeko kimika eta biologia kimikako irakaslea da. Horrez gain, RCSB Protein Data Bank-eko zuzendari ohia izan da. Azido nukleikoen datu-basearen sortzailea eta zuzendaria ere bada, eta proteinen egitura-ekimenaren egiturazko Genomikari buruzko ezagutze basea bideratzen du.[1] [2] Egiturazko biologa gisa bezala, bere lanak proteina-azido nukleikoko konplexuen egiturazko analisiak, eta uraren funtzioa interakzio molekularretan barne hartzen ditu.

Helen M. Berman

Bizitza
JaiotzaChicago, 1943 (80/81 urte)
Herrialdea Ameriketako Estatu Batuak
Hezkuntza
HeziketaBarnard College
Pittsburgheko Unibertsitatea
Irakaslea(k)Barbara Wharton Low (en) Itzuli
Jarduerak
Jarduerakkimikaria, bioinformatikaria, kristalografoa, biofisikaria, biokimikaria eta ikertzailea
Enplegatzailea(k)Fox Chase Cancer Center (en) Itzuli  (1969 -  1989)
Rutgers Unibertsitatea  (1989ko irailaren 1a -
Rutgers Unibertsitatea  (2016ko uztailaren 1a -
Jasotako sariak
KidetzaArteen eta Zientzien Ameriketako Estatu Batuetako Akademia

Jatorria eta ikasketak aldatu

Helen M. Berman Illinois, Chicagon jaio zen, eta Brooklynen hazi, Nueva Yorken. Bermanen aita, David Bernstein, medikua zen eta bere ama, Dorothy Bernstein, bere senarraren bulegoko praktika zuzendu zuen. Bere aitak inspiratuta, zientziarekiko interesa zuen txikitatik, eta zientzialari edo doktore bihurtzeko asmoa zuen.

Bigarren hezkuntzan zehar, Bermanek Ingrith Deyrup laborategian lan egin zuen, Barnard Collegen. Ingrith Deyrupek Berman Barnard Unibertsitatera joatera bultzatu zuen. Unibertsitatean zegoela, Columbiako Unibertsitateko Medikuen eta Zirujanoen Fakultateko laborategi batean lan egin zuen Barbara Lowrekin. Han, Bermanek kristalografiari buruz ikasi zuen, ondoren bere bizitza osorako grina bihurtuko zena. 1964an, Bernard Collegen, kimikan graduatu zen.

Graduatu ondoren, Berman graduondoko eskolarentzako Pittsburgheko Unibertsitatera joan zen, eta toki hori hautatu zuen herrialde hartan kristalografiaren gaia eskaintzen zen departamentu bakarra zelako. Han, George A. Jeffreyrekin lan egin zuen karbohidratoen egituran, eta 1967an doktoretza jaso zuen. Bermanek beste bi urtez egon zen Pittsburgheko Unibertsitatean, doktoretza ondoko ikertzaile bezala.

Karrera aldatu

1969ean, Berman Filadelfiako Fox Chase Minbizi Zentrora bizitzera joan zen. 1973an fakultateko kide gisa bezala bere ikerketa-programa askea hasi aurretik, Jenny Gluskerren laborategian lan egin zuen. Fox Chasenen, Bermanek azido nukleikoen egituran eta bioinformatikan interesatu zen.

1971ko ekainean, Bermanek Cold Spring Harbor laborategiko sinposio batera joan zen. Bertan, hainbat zientzialariek adostu zuten proteina egituren kopuruari buruzko datuak datu-base batean artxibatu beharko liratekeela. Bilera horren ondorioz, Proteinen Datu Bankua (PDB) sortu zen, Brookhaveneko Laborategi Nazionalean.

1989an, Berman Rutgersera bizitzera joan zen. 1992an, beste zientzialari batzuekin batera, azido nukleikoaren[3] egiturari buruzko informazioa biltzeko eta zabaltzeko, azido nukleikoen datu-basea (NDB) sortu zuten, eta Bermanek sortzaileetako bat izan zen. Rutgers-en, azido nukleikoak aztertzen jarraitu zuen, proteinekin zituen elkarreraginak aztertzen, eta kolagenoaren egitura ere ikertu zuen, Barbara Brodsky eta Jordi Bella lankidekin.

1998an, Berman eta Philip Bourne elkarrekin lehiatu ziren eta Protein Data Bankerako kontratua irabazi zuten, eta datu-basea Brookhavenetik Research Collaboratory for Structural Bioinformatics-era (RCSB) lekualdatu zen. Gaur egun, Rutgers eta San Diego Kaliforniako Unibertsitatearen arteko lankidetza dena. Lankideekin batera, Bermanek datuak administratzeko sistema berria diseinatu zuen, erabiltzaile-tresna berriak gehitu zituen eta datu-basea bilatzeko aukera eman zuen.

2003az geroztik, PDBren artxiboa Protein Data Bank (wwPDB) erakundeak administratzen du. Bermanek sortutako elkartea da, eta PDBren datuak gordetzeko, prozesatzeko eta banatzeko zentro gisa moduan jarduten dute: RCSB, PDBE Europan eta PDBj Japonian.

2006an, BioMagResData (BMRB) datu-bankua, Erresonantzia magnetiko nuklearreko egiturentzako erabiltzen dena (RMN), wwPDBko[4] laugarren kidea bihurtu zen.

Era berean, RCSB buru zela, proteinen egiturari buruzko ekimenaren Egitura Genomikaren ezagutza-basea (gaztelaniaz, PSI) abiarazi zen. 2008ko udaberrian, etengabe eguneratutako atari bat emateko, datuak eta PSI-ren ahalenginen beste baliabide batzuk ikertzeko[5].

Berman komunitate zientifikoan ere aditu da lanean. 1988an Ameriketako Estatu Batuetako Kristalografia Elkarteko kargua izan zuen, Osasunaren Institutu Nazionalei eta Zientziaren Fundazio Nazionalari aholkuak eman zizkien, eta hainbat aldizkariren argitalpen-batzordeko kide izan zen. Bere lana binaka berrikusitako aldikari zientifikoetan argitartu da.

Ohoreak eta sariak aldatu

  • New Jerseyko arrkastako emakumea (1993).
  • Zientziaren Aurrerapenerako Amerikako Elkarteko kidea (1996).
  • Emakume Zientifiko Nabarmenaren Saria, Zientzia Emakumeentzako Elkartea, Nueva York (1999).
  • Sigma Xi: ikerketa Zientifikoko Elkartea (2007-2009).
  • Zerbitzu Bereizgarriaren Saria, Biofisika Elkartea (2000).
  • Kidea, Biofisika Elkartea (2001)[6].
  • MJ Buerger saria, American Crystallographic Association (2006)[7].
  • Pittsburgheko Unibertsitateko Kimikako ikasle ohien saria (2010).
  • Amerikako Kristalografia Elkarteko kidea (2011).
  • Proteina-elkartearen Carl Bräden saria (2012).
  • Ameriketako Biokimika eta Biologia Molekularreko Elkartearen Biozientzia konputazionalentzako DeLano saria (2013)[8].
  • Bizitzaren zientzietako sarbide irekiko Benjamin Franklin Saria (2014).

Bizitza pertsonala aldatu

Berman bi aldiz ezkondu da. Victor Berman ingeniariarekin 1960ko hamarkadan, eta Peter Young biologo molekularraekin 1976tik 1999ra. 1979an bere lehen semea izan zuen, Jason Asher Young, fisikaria dena.

Erreferentziak aldatu

  1. ↑ «Helen M. Berman» scholar.google.com (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  2. ↑ (Ingelesez) Demasters, Karen. (2000-11-26). «ON THE MAP; A Bank Where the Currency Is Molecules» The New York Times ISSN 0362-4331. (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  3. ↑ «NDB - General Information» web.archive.org 2008-09-20 (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  4. ↑ Berman, Helen; Henrick, Kim; Nakamura, Haruki; Markley, John L.. (2007-1). «The worldwide Protein Data Bank (wwPDB): ensuring a single, uniform archive of PDB data» Nucleic Acids Research 35 (Database issue): D301–D303.  doi:10.1093/nar/gkl971. ISSN 0305-1048. PMID 17142228. PMC 1669775. (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  5. ↑ Kouranov, Andrei; Xie, Lei; de la Cruz, Joanna; Chen, Li; Westbrook, John; Bourne, Philip E.; Berman, Helen M.. (2006-01-01). «The RCSB PDB information portal for structural genomics» Nucleic Acids Research 34 (Database issue): D302–D305.  doi:10.1093/nar/gkj120. ISSN 0305-1048. PMID 16381872. PMC 1347482. (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  6. ↑ «Two distinguished Rutgers chemists named Biophysical Socie...( NEW BRUNSWICK/PISCATAWAY N.J. --...)» web.archive.org 2016-03-03 (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  7. ↑ «Rutgers Professor Helen M. Berman to Receive the Prestigious M.J. Buerger Award» web.archive.org 2011-07-20 (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).
  8. ↑ «Berman recognized for her efforts in removing barriers to data access» web.archive.org 2015-01-22 (Noiz kontsultatua: 2022-05-03).

Kanpo estekak aldatu

"https://eu.wikipedia.org/w/index.php?title=Helen_M._Berman&oldid=8967695"(e)tik eskuratuta